ケモインフォマティクスのソースを表示

{{出典の明記|date=2011年12月}}
'''ケモインフォマティクス'''（[[英語]]: Cheminformatics、chemoinformatics、chemioinformatics、chemical informatics、'''化学情報学'''）は、[[コンピュータ]]と[[情報工学|情報化]]技術を[[化学]]領域の幅広い問題への応用である。'''ケモインフォマティクス'''および'''化学情報'''の技術は[[医薬品化学]]の創薬研究過程でも利用されている。

== 歴史 ==
ケモインフォマティクスという用語はF・K・ブラウンによって1998年に以下のように定義された<ref name="Brown_1998">{{Cite book | author = F. K. Brown | title = Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery | journal = Annual Reports in Med. Chem. | year = 1998 | volume = 33 | pages = 375–384 | doi = 10.1016/S0065-7743(08)61100-8 | series = Annual Reports in Medicinal Chemistry | isbn = 978-0-12-040533-6}}</ref><ref>{{cite journal | author = Brown, Frank | title = Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update | journal = Curr. Opin. Drug Discov. Devel. |year = 2005 | volume = 8 | issue = 3 | pages = 296–302|pmid= 15892243}}</ref>。

<blockquote>
「ケモインフォマティクスとは、薬剤リード同定および最適化の分野においてより速く、より良い決定を下すという意図された目的のために、データを情報へ、情報を知識へと変換するためそれらの情報源を混合することである。」
</blockquote>

以後、英語ではCheminformaticsとChemoinformaticsの2種類の綴りが使われており、Cheminformaticsがより人気の用語としての地位を築いてきた<ref>[http://www.molinspiration.com/chemoinformatics.html Cheminformatics or Chemoinformatics ?<!-- Bot generated title -->]</ref><ref>[http://www.genomicglossaries.com/content/glossary_faq.asp#3] www.genomicglossaries.com Tips & FAQs for the Biopharmaceutical glossaries #3</ref>。ヨーロッパの[[アカデミア]]は2006年にChemoinformaticsで妥結したが<ref name="Obernai">[http://infochim.u-strasbg.fr/chemoinformatics/Obernai%20Declaration.pdf Obernai Declaration]</ref> 、2009年に''Journal of Cheminformatics''が創刊され、短い綴りのCheminformaticsが強く後押しされた。

== 基本 ==
ケモインフォマティクスは[[化学]]領域と[[情報工学]]領域の融合した学際領域で、特に化学における[[グラフ理論]]<ref>{{cite book|author= D. Bonchev, D.H. Rouvray|title=Chemical Graph Theory: Introduction and Fundamentals|publisher= Gordon and Breach Science Publishers|year= 1990|isbn= 0-85626-454-7}}</ref>や化学物質[[空間]]のデータ探索に関する研究が盛んである。化学物質空間は少なくとも<math>10^{62}</math>個の分子構造が存在すると見積もられている<ref>{{cite journal|author=R. Lahana|title=How many leads from HTS?|journal= Drug Discovery Today|year= 1999|volume= 4|pages= 447-448|doi= 10.1016/S1359-6446(99)01393-8}}</ref>。それに比して、2005年現在既知の化学物質の総数は<math>10^{9}</math>程度である。

== 応用 ==
=== 検索 ===
[[計算機化学]]の技術を使用して巨大な化合物の[[in silico]] ''virtual libraries''を構築すると、化学物質空間のデータ探索に効果的である。

=== 定量的構造活性相関 (QSAR) ===
[[定量的構造活性相関]]や定量的構造属性相関（[[w:en:QSPR|en:QSPR]]）の値を算出し化合物の活性をその分子構造から推定するのに用いられる。

=== ファイルフォーマット ===
「In silico」の化学構造を表す内部表現形として, [[Extensible Markup Language|XML]]技術に基づいた[[Chemical Markup Language]]や[[SMILES記法]]などが使用される。この内部表現形は巨大な[[化学データベース]]において外部とデータ交換する際にも使用される。　[[化学データベース]]に詳しい。

== 出典 ==
{{reflist}}

== 関連文献 ==
* [[ヨハン・ガスタイガー|Gasteiger J.]] (Editor), Engel T.(Editor): ''Chemoinformatics : A Textbook''. John Wiley & Sons, 2004, ISBN 3-52730-681-1

日本語で読めるものとしては、
* [[ヨハン・ガスタイガー|J. Gasteiger]]・T. Engel編、[[船津公人]]監訳：ケモインフォマティクス -予測と設計のための化学情報学- 丸善株式会社(2005)

== 関連項目 ==
* [[計算化学]]
* [[計算機化学]]
* [[計算科学]]
* [[統計]]
* [[データマイニング]]
* [[可視化|科学データの可視化]]
* [[バイオインフォマティクス]]
* [[計算機化学]]
* [[ヨハン・ガスタイガー]]
*[[分子記述子]]

== 外部リンク ==
* Comprehensive cheminformatics link list and data set repository:（英語）http://www.cheminformatics.org
* A cheminformatics glossary:（英語） http://www.genomicglossaries.com/content/chemoinformatics_gloss.asp
* XML- CML.ORG - The Site for Chemical Markup Language:（英語） http://www.xml-cml.org/
* VCCLAB Virtual Computational Chemistry Laboratory:（英語） http://www.vcclab.org
* Accelrys Software Inc. http://www.accelrys.com/jp/chem/index.html
* ChemAxon（英語） http://www.chemaxon.com/

{{Normdaten}}
{{DEFAULTSORT:けもいんふおまていくす}}
[[Category:計算化学]]
[[Category:ケモインフォマティクス|*]]
[[Category:創薬]]
[[Category:研究の計算分野]]
[[Category:応用統計学]]